単式・島式混合２面３線でホームへは構内踏切で結ばれている。
直営駅であり、管理駅として常陸青柳～常陸鴻巣の各駅と常陸太田支線の各駅を管理している。
上菅谷駅
水郡線
ＥＶ－４の１０１のみです。入場券は購入できます。
（常陸太田支線）
